MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Moorella thermoacetica ATCC 39073 chromosome

Total Repeats: 7926

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007644	CGG	2	6	7	12	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007644	TCC	2	6	60	65	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_007644	CTG	2	6	82	87	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007644	CCT	2	6	232	237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_007644	T	6	6	287	292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007644	AAGGAA	2	12	302	313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007644	TCT	2	6	413	418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007644	AGG	2	6	436	441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007644	CAGC	2	8	1801	1808	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_007644	TAC	2	6	1844	1849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_007644	GAT	3	9	1870	1878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007644	GGA	2	6	1879	1884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007644	A	6	6	1884	1889	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007644	GCCC	2	8	4447	4454	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15	NC_007644	GAG	2	6	4462	4467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007644	GGCA	2	8	4748	4755	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_007644	GGA	2	6	4818	4823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007644	CTAG	2	8	6824	6831	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_007644	GTA	2	6	9348	9353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007644	GCC	2	6	9375	9380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_007644	CAC	2	6	9388	9393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_007644	A	7	7	9398	9404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007644	TGA	2	6	9423	9428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007644	G	6	6	9437	9442	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007644	GAAG	2	8	10349	10356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007644	GGT	2	6	10963	10968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007644	AAGA	2	8	11069	11076	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007644	ATTT	2	8	11153	11160	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007644	TAAATA	2	12	11181	11192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007644	GTAA	2	8	11207	11214	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007644	ATT	2	6	12121	12126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007644	A	6	6	13104	13109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007644	AGG	2	6	13136	13141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007644	GGA	2	6	14548	14553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007644	CCG	2	6	17026	17031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_007644	CAC	2	6	17653	17658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_007644	T	6	6	17692	17697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007644	T	6	6	18418	18423	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007644	CGG	2	6	18524	18529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_007644	GA	3	6	18545	18550	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007644	TGG	2	6	18553	18558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007644	TGG	2	6	18560	18565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007644	ATA	2	6	18681	18686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007644	GCT	2	6	18763	18768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_007644	AGG	2	6	18793	18798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007644	TGC	2	6	18806	18811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_007644	TTTAT	2	10	18842	18851	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007644	GCG	3	9	20076	20084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_007644	CGTAA	2	10	20102	20111	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_007644	CTG	2	6	20137	20142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_007644	AGTCA	2	10	20162	20171	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_007644	CGC	2	6	20176	20181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_007644	AGC	2	6	20185	20190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_007644	ACT	2	6	20216	20221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_007644	TAA	2	6	20261	20266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007644	GAA	2	6	20279	20284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007644	GGA	2	6	20295	20300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007644	CCG	2	6	21913	21918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_007644	ATA	2	6	21930	21935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007644	TGG	2	6	21959	21964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007644	TCC	2	6	25440	25445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_007644	AG	3	6	26077	26082	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007644	GA	3	6	26241	26246	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007644	CT	3	6	26324	26329	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_007644	A	6	6	26435	26440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007644	CG	3	6	26447	26452	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_007644	AGG	2	6	26491	26496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007644	GC	3	6	26519	26524	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_007644	T	6	6	26527	26532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007644	AGC	2	6	26562	26567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_007644	AGC	2	6	26620	26625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_007644	CTCGA	2	10	27105	27114	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
73	NC_007644	TGA	2	6	27128	27133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007644	CT	3	6	27157	27162	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_007644	AGTAT	2	10	27168	27177	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007644	G	7	7	27179	27185	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007644	ACG	2	6	28393	28398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_007644	TTTG	2	8	28438	28445	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007644	ATCG	2	8	28474	28481	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_007644	TAA	2	6	28544	28549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007644	GA	3	6	28594	28599	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007644	CT	3	6	28676	28681	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_007644	GACCT	2	10	28782	28791	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
84	NC_007644	CCGG	2	8	28799	28806	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_007644	CGA	2	6	28837	28842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_007644	AGC	2	6	28874	28879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_007644	AGC	2	6	28888	28893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_007644	AAG	2	6	28988	28993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007644	ATT	2	6	28996	29001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007644	AAT	2	6	29011	29016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007644	T	6	6	29020	29025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007644	TAT	2	6	29070	29075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007644	AAG	2	6	29084	29089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007644	AGG	2	6	30878	30883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007644	AAT	2	6	31840	31845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007644	GTA	2	6	32118	32123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007644	CAA	2	6	32420	32425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_007644	GC	3	6	32527	32532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_007644	GCAG	2	8	32606	32613	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_007644	A	7	7	32676	32682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007644	AGA	2	6	32688	32693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007644	GCT	2	6	33223	33228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_007644	AAAC	2	8	33301	33308	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_007644	T	6	6	36145	36150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007644	AAAAT	2	10	36231	36240	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007644	GGT	2	6	36250	36255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007644	TTA	2	6	36303	36308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007644	TGCC	2	8	36320	36327	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_007644	GCT	2	6	36374	36379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_007644	T	6	6	36395	36400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007644	CAT	2	6	36408	36413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_007644	AGG	2	6	36427	36432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007644	TCA	2	6	36459	36464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_007644	GAT	2	6	36488	36493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007644	ATG	2	6	36620	36625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007644	TC	3	6	36628	36633	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_007644	A	7	7	36712	36718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007644	GGC	2	6	36757	36762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_007644	GGC	2	6	36778	36783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_007644	TGA	2	6	36794	36799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007644	GCCA	2	8	36925	36932	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_007644	CCA	2	6	36941	36946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_007644	GGC	2	6	36949	36954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_007644	CAT	2	6	37014	37019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_007644	ATT	2	6	37108	37113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007644	CCA	2	6	37142	37147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_007644	ACA	2	6	37205	37210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_007644	CGGG	2	8	37339	37346	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
129	NC_007644	TCC	2	6	37352	37357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_007644	CAG	2	6	37402	37407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_007644	CGG	2	6	37492	37497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_007644	GGA	2	6	37542	37547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007644	AAG	2	6	37586	37591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007644	TGA	2	6	37677	37682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007644	GCC	2	6	37722	37727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_007644	CAG	2	6	37821	37826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_007644	GAG	2	6	37915	37920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007644	GAG	2	6	39292	39297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007644	T	6	6	40660	40665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007644	ACCC	2	8	40695	40702	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
141	NC_007644	ATC	2	6	40716	40721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_007644	ACC	2	6	41545	41550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_007644	GGA	2	6	41577	41582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007644	TA	3	6	41586	41591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007644	GTA	2	6	43122	43127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007644	AGC	2	6	43795	43800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_007644	CCG	2	6	43827	43832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_007644	GAG	2	6	43923	43928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_007644	TAC	2	6	44887	44892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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155	NC_007644	TAATA	2	10	47322	47331	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_007644	GCC	2	6	51470	51475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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166	NC_007644	TGG	2	6	51494	51499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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170	NC_007644	GTA	2	6	52508	52513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_007644	TAT	2	6	54977	54982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_007644	ATT	2	6	56927	56932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_007644	CTG	2	6	56949	56954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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193	NC_007644	TTG	2	6	57423	57428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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242	NC_007644	CAG	2	6	78951	78956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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281	NC_007644	CAC	2	6	96482	96487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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283	NC_007644	CCT	2	6	97390	97395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
284	NC_007644	AGC	2	6	97460	97465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
285	NC_007644	A	7	7	98775	98781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_007644	TCC	2	6	98828	98833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
287	NC_007644	CGG	2	6	98898	98903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_007644	GAAA	2	8	98917	98924	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
289	NC_007644	ATA	2	6	99429	99434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_007644	ACC	2	6	99509	99514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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292	NC_007644	ACC	2	6	99609	99614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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423	NC_007644	ATT	2	6	139295	139300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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